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教师名录

欧宝在线登录:彭文舫

作者:欧宝在线登录发布时间:2022年03月04日 08:08

一、基本信息

彭文舫,博士,副教授,硕士研究生导师,2017年湖北省省级人才项目获得者

电子邮件:wenfang(AT)hubu.edu.cn

研究领域:微生物遗传学、CRISPR-Cas病毒免疫机制、基因编辑

二、教育背景

2012.07–2015.03 丹麦哥本哈根大学,理学博士

2010.09–2015.06 华中农业大学,理学博士

2005.09–2008.07 中国农业科学院,农学硕士

2001.09–2005.07 长江大学,农学学士

三、工作经历

2017.07至今     欧宝在线登录,副教授

2015.11–2017.06  欧宝在线登录,讲师

2008.08–2010.08  中国农业科学院油料作物研究所,研究助理

四、科研/教改项目

(一)主持项目

1.      欧宝在线登录教学建设项目(2020C01):微生物遗传学(双语)精品课程,在研

2.      湖北省人才计划专项经费(2017–2022),负责

3.      湖北省自然科学基金面上项目2017CFB538),基于嗜热古菌冰岛硫化叶菌CRISPR-Cas系统的DNA/RNA编辑平台的搭建和优化,结题

4.      湖北省教育厅青年人才项目Q20161007),利用酵母内质网滞留系统促进人凝血因子IXFIX)高活性表达的研究,结题

5.      欧宝在线登录青年科学基金,冰岛硫化叶菌多个CRISPR-Cas系统病毒免疫协作机制,结题

(二)参与项目

1.      国家自然科学基金面上项目(31870057),酿酒酵母内质网滞留信号介导的蛋白质滞留效应研究,在研

2.      丹麦独立研究(自然科学类)基金项目(DFF-1323-00330),Functional analyses of archaeal Cas/Cmr modules and their integration and cooperation in antiviral defense,258万丹麦克朗,结题

3.      国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金(31128011),极端嗜热古菌CRISPR/Cas系统的功能研究,结题

4.      国家自然科学基金面上项目(30471062),花生种子贮藏蛋白在抗黄曲霉产毒中的作用与遗传分化,结题

5.      国家自然科学基金面上项目(30571132),中国花生核心种质的构建及重要新基因源发掘,结题

五、发表论文(#共同第一作者,*通讯作者)

(一)第一或通讯作者科研论文

1.        Li J.#, Wang B.#, Yang Q., Si H., Zhao Y., Zheng Y.*, Peng W.* (2022). Enabling efficient genetic manipulation in a rare actinomycete Pseudonocardia alni Shahu. Frontiers in Microbiology. 13: 848964.

2.        Hao Y., Wang Q., Li J., Yang S., Zheng Y.*, Peng W.* (2022). Double nicking by RNA-directed Cascade-nCas3 for high-efficiency large-scale genome engineering. Open Biology. 12(1): 210241.

3.      Hu X.#, Liu H.#, Li J., Wang J., Peng W.* (2021). Protein macrocyclization by a recombinant asparaginyl endopeptidase. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 53(11): 1567–1570.

4.      Zheng Y., Li J., Wang B., Han J., Hao Y., Wang S., Ma X., Yang S., Ma L., Yi L.*, Peng W.* (2020). Endogenous Type I CRISPR-Cas: From Foreign DNA Defense to Prokaryotic Engineering. Frontiers in Bioengineering & Biotechnology. 8: 62.

5.      Zheng Y., Han J., Wang B., Hu X., Li R., Shen W., Ma X., Ma L., Yi L.*, Yang S.*, Peng W.* (2019). Characterization and repurposing of the endogenous Type I–F CRISPR–Cas system of Zymomonas mobilis for genome engineering. Nucleic Acids Research 47(21): 11461–11475.

6.      Peng W., Feng M., Feng X., Liang Y. X., She Q.* (2015). An archaeal CRISPR type III–B system exhibiting distinctive RNA targeting features and mediating dual RNA and DNA interference. Nucleic Acids Research 43(1): 406-417.

7.      Peng W., Li H., Hallstrom S., Peng N., Liang Y. X., She Q.* (2013). Genetic determinants of PAM–dependent DNA targeting and pre-crRNA processing in Sulfolobus islandicus. RNA Biology 10(5): 738–748.

(二)合作作者科研论文

1.      Xie X.-H., Fu X., Yan X.-Y., Peng W.-F., Kang L.-X.* (2021). A broad-specificy chitinase from Penicillium oxalicum k10 exhibits antifungal activity and biodegradation properties of chitin. Marine Drugs. 19: 356.

2.      Lv Y.#, Jiang Y.#, Peng W., Fang Y., Dong W., Zhou J., Xin F.*, Zhang W.* Jiang M.* (2021). Genetic manipulation of non-solvent-producing microbial species for effective butanol production. Biofuels, Bioproducts & Biorefining. 15(3): 119–130.

3.      Guo F.#, Dai Z.#, Peng W., Zhang S., Zhou J., Ma J., Dong W., Zhou J., Xin F.*, Zhang W.* Jiang M.*  (2021). Metabolic engineering of Pichia pastoris for malic acid production from methanol. Biotechnology & Bioengineering. 118(1): 357–371.

4.      Lu J., Peng W., Lv Y., Jiang Y., Xu B., Zhang W., Zhou J., Dong W., Xin F.*, Jiang M.* (2020). Application of cell immobilization technology in microbial cocultivation systems for biochemicals production. Industrial & Engineering Chemistry Research 59: 17026–17034.

5.      Shen W., Zhang J., Geng B., Qiu M., Hu M., Yang Q., Bao W., Xiao Y., Zheng Y., Peng W., Zhang G., Ma l., Yang S.* (2019). Establishment and application of a CRISPR-Cas12a assisted genome–editing system in Zymomonas mobilis. Microbial Cell Factory 18: 162.

6.      Fan X., Li X., Zhou Y., Mei M., Liu P., Zhao J., Peng W., Jiang Z.-B., Yang S., Iverson B. L., Zhang G.*, Yi L.* (2019). Quantitative Analysis of the Substrate Specificity of Human Rhinovirus 3C Protease and Exploration of Its Substrate Recognition Mechanisms. ACS Chemical Biology 15: 63–73.

7.      Han W.#, Li Y.#, Deng L., Feng M., Peng W., Hallstrom S., Zhang J., Peng N., Liang Y. X., White M. F. White, She Q.* (2017). A type III-B CRISPR-Cas effector complex mediating massive target DNA destruction. Nucleic Acids Research 45(4): 1983–1993.

8.      He F., Vestergaard G., Peng W., She Q., Peng X.* (2017). CRISPR-Cas type I-A Cascade complex couples viral infection surveillance to host transcriptional regulation in the dependence of Csa3b. Nucleic Acids Research 45(4): 1902–1913.

9.      Liu T., Liu Z., Ye Q., Pan S., Qang X., Peng W., Li Y., Liang Y. X., She Q., Peng N.* (2017). Coupling transcriptional activation of CRISPR-Cas system and DNA repair genes by Csa3a in Sulfolobus islandicus. Nucleic Acids Research, 45(15): 8978–8992.

10.  Mei M., Zhou Y., Peng W., Yu C., Ma L., Zhang G.*, Yi L.* (2017). Application of modified yeast surface display technologies for non–antibody protein engineering. Microbiological Research 196: 118–128.

11.  Mei M., Zhai C., Li X., Zhou Y., Peng W., Ma L., Wang Q., Iverson B. L., Zhang G.*, Yi L.* (2017). Characterization of aromatic residue-controlled protein retention in the endoplasmic reticulum of Saccharomyces cerevisiae. Journal of Biological Chemistry, 292(50): 20707–20719.

12.  Garrett R. A.*, Shah S. A., Erdmann S., Liu G., Mousaei M., Leon-Sobrino C., Peng W., Gudbergsdottir S., Deng L., Vestergaard G., Peng X., She Q. (2015). CRISPR-Cas adaptive immune systems of the Sulfolobales: Unravelling their complexity and diversity. Life (Basel) 5(1): 783–817.

六、授权专利

(一)第一发明人

1.      彭文舫,郝怡乐(2022)一种基于CRISPR-nCas3系统的高效基因组大片段删除方法及应用(ZL202110639401.1

2.      彭文舫,郝怡乐(2022)一种含nCas3单链核酸酶切酶的工程菌、制备方法及应用(ZL202110639403.0

3.      彭文舫,郝怡乐(2022)一种nCas3单链核酸酶切酶及其应用(ZL202110638175.5

4.      彭文舫,杨世辉,郑艳丽,易犁,马立新(2021)基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的基因组大片段高效删除方法及其应用(ZL201910692120.5

5.      彭文舫,杨世辉,郑艳丽,易犁,马立新(2021)基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的多基因位点同时编辑方法及其应用(ZL201910692118.8

6.      彭文舫,胡晓韵,易犁,范贤,马立新(2021)一种AEP环化酶在毕赤酵母中的表达方法及其应用ZL201910712032.7

7.      彭文舫,胡晓韵,易犁,范贤,马立新(2021)一种AEP环化酶在大肠杆菌中的融合表达方法、AEP环化酶环化能力鉴定方法及其应用ZL201910712666.2

(二)非第一排名发明人

1.      杨世辉,彭文舫,郑艳丽,易犁,马立新(2021)一种基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的基因编辑方法及其应用(ZL201910692143.6

2.      杨世辉,沈威,彭文舫,马立新(2021)一种基于CRISPR–Cas12a系统的运动发酵单胞菌基因编辑方法及其应用ZL201910692112.0

3.      张桂敏,卢争辉,袁芯,彭文舫,石云云,蒋思婧,马延和(2021)一种特异性调节枯草芽孢杆菌外源基因表达的dcas9–ω融合蛋白及其应用.ZL201710965231.X

4.      杨世辉,彭文舫,沈威,郑艳丽,易犁,马立新2021一种基于运动发酵单胞菌的CRISPR–Cas系统、基因组编辑体系及其应用PCT/CN2019/112556

5.      易犁,范贤,彭文舫,周瑜,喻婵,张桂敏2020)一种切割效率增强的HRV 3C蛋白酶底物突变体及其应用.ZL201710956966.6

6.      易犁,周瑜,张桂敏,彭文舫,马立新,马延和 (2020) 一组不同启动子介导的蛋白酶高通量筛选载体及筛选方法ZL201510802312.9

 

 

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